理论上，FET能避免高E2状态，提供接近生理的胚胎着床环境，降低LBW和PTB等不良妊娠并发症风险。但是，由于冷冻、解冻程序及不孕症本身可能会引起早期胚胎的表观遗传变化，从而改变FET后代的宫内生长潜力，因此还须考虑FET相关的其他不良围产期结果。研究表明，与新鲜周期相比，FET后的单胎巨大儿、大于胎龄儿的风险和围产期死亡率均增加。另外,对比新鲜ET和自然受孕的单胎，FET妊娠后发生妊娠期高血压疾病的相对风险增加。

与卵裂期胚胎移植与CT比较，BT可以促进优质胚胎的选择，提高每次移植的妊娠率和活产率。但是,延长培养时间增加了对潜在外部压力因素的暴露，如温度、pH值和氧气浓度，这可能干扰胚胎植入和胎盘形成。与此同时，BT减少了胚胎和子宫内膜在植入前的交流时间，可能影响它们的同步。另外，培养基可能会影响特定基因的表达，增加产科并发症并影响围产期结局。研究显示，与新鲜CT相比，BT后出生的婴儿PTB及VPTB的风险更高。在选择单囊胚移植时，BT受孕有较高的单卵双胎风险。鲜胚移植周期中，BT较CT单胎妊娠发生前置胎盘的风险更高。

在欧洲，IVF-OD周期每年大约有30000个周期，而在我国，由于法律法规比较严格,IVF-OD周期并不多。荟萃分析表明，IVF-OD是妊娠期高血压、子痫前期和重度子痫前期等不良围产期结局的独立危险因素。从IVF-OD妊娠中得到的证据表明，其绒毛外滋养层细胞及胎盘-子宫内膜界面的免疫排斥可能阻碍螺旋动脉的重塑，进而导致胎盘功能不全。IVF-OD母亲面临比自然受孕更高程度的抗原差异。同时，卵母细胞供体与其受体之间的人类白细胞抗原不相容也可能会促进母体免疫失衡，从而增加胎盘病变的风险。